Contamination par les voies respiratoires
Les micro-organismes peuvent pénétrer dans l'organisme par l'air que nous respirons. De fines gouttelettes contenant les micro-organismes sont éjectées dans l'air, c'est le cas pour la transmission du virus de la grippe A ou pour le Coronavirus. Les micro-organismes se propageant par l'air sont les plus contagieux.
Contamination par la voie intestinale
Le second mode de contamination est l'eau et l'alimentation. Les aliments et l'eau peuvent être contaminés par des bactéries comme le choléra pour l'eau ou la listéria qui se trouve dans certains fromages.
Contamination par le sang
Le tétanos se transmet par le sang, il suffit d'une toute petite piqûre de rosier pour l'attraper.
Contamination par les voies buccales et sexuelles
La dernière voie d'entrée des micro-organismes sont les fluides et sécrétions buccales ou sexuelles.Certains micro-organismes ne peuvent pénétrer dans le corps humain que par une seule voie alors que d'autres en utilisent plusieurs. Le virus du Sida contamine par le sang et par les fluides sexuels.